Badania Euro NCAP są systematycznie aktualizowane i coraz bardziej wymagające. Obejmują długą listę testów sprawdzających samochód pod kątem bezpieczeństwa pasażerów i innych użytkowników dróg oraz skuteczność systemów bezpieczeństwa czynnego. Testy zderzeniowe obejmują zderzenie czołowe z prędkością 50 km/h połową szerokości samochodu, w które uderza nadjeżdżająca odkształcalna bariera, zderzenie czołowe pełną szerokością auta w sztywną barierę, zderzenie boczne z mobilną odkształcalną barierą, która uderza w drzwi kierowcy, oraz zderzenie samochodu bokiem ze słupem. W czasie tych testów sprawdzany jest wpływ kolizji zarówno na kierowcę i dorosłych pasażerów, jak i na dzieci. Badania skutków zderzenia samochodu z pieszym obejmują wiele różnych konfiguracji z użyciem fantomu głowy i nogi osoby dorosłej oraz dziecka. W następnej kolejności sprawdzana jest skuteczność systemów zapobiegania kolizjom z pieszymi i rowerzystami, z innymi samochodami, a także skuteczność układów utrzymywania pasa ruchu i aktywnych tempomatów.
Toyota Yaris Cross dołącza do dwóch innych modeli Toyoty – wodorowego sedana Mirai i Yarisa czwartej generacji – które w ostatnim czasie zdobyły 5 gwiazdek Euro NCAP. Nowy japoński crossover otrzymał ocenę 86 procent za ochronę dorosłych pasażerów i 84 procent za ochronę przewożonych w samochodzie dzieci. Skuteczność systemów bezpieczeństwa czynnego Euro NCAP oceniło na 81 procent, a ochronę pieszych i rowerzystów na 78 procent. Yaris Cross zapewnia szczególnie dobrą ochronę głowy i szyi kierowcy i pasażerów, do czego przyczyniają się zarówno wysokiej jakości fotele i skuteczne poduszki powietrzne przednie i boczne, jak i nowa centralna poduszka powietrzna między przednimi fotelami.
Samochód ten wyróżnia się bogatym zestawem zaawansowanych technologii wsparcia kierowcy Toyota Safety Sense 2.5, które są w stanie wykryć więcej potencjalnych sytuacji zagrożenia i szybciej zareagować, by automatycznie uniknąć kolizji lub ograniczyć jej skutki. Zgodnie z zasadą, że „bezpieczeństwo nie powinno być opcją”, najnowsza generacja układów bezpieczeństwa czynnego Toyota Safety Sense 2.5 oferowana jest w standardzie we wszystkich wersjach. Standard wyposażenia zawiera: układ wczesnego reagowania w razie ryzyka zderzenia (PCS) z systemem wykrywania pieszych w dzień i w nocy oraz rowerzystów w dzień, układ zapobiegania kolizjom na skrzyżowaniach, wspomaganie kierownicy w razie ryzyka zderzenia, inteligentny tempomat adaptacyjny, asystenta utrzymywania pasa ruchu (LTA), system ostrzegania o niezamierzonej zmianie pasa ruchu (LDA), system rozpoznawania znaków drogowych (RSA), automatyczne światła drogowe (AHB) oraz system eCall, który w razie wypadku automatycznie powiadomi odpowiednie służby i przekaże lokalizację pojazdu.
