Wyższe Seminarium Duchowne Diecezji Koszalińsko-Kołobrzeskiej w Koszalinie powstało na mocy dekretu biskupa Ignacego Jeża 25 marca 1981.
Patronem WSD Koszalin jest św. Jan Kanty.
Seminarium początkowo nie miało swojej siedziby, a pierwsi studenci – diakoni przebywali w Złocieńcu.
Wydarzeniem, które szczególnie naznaczyło historię koszalińskiego seminarium, była niewątpliwie wizyta ojca świętego Jana Pawła II.
Podczas swojej IV pielgrzymki do Ojczyzny, którą rozpoczął właśnie w Koszalinie 1 czerwca 1991 r., dokonał poświęcenia całości seminarium (w Wilkowie dzisiaj dzielnica Koszalina), choć prace budowlane trwały jeszcze przy sali gimnastycznej i auli.
Papież spędził w seminarium noc i spotkał się z klerykami.
Ks. Wojciech Wójtowicz był szóstym z kolei rektorem seminarium. Urzędował w latach 2013–2020. P.o. rektora został ksiądz Jarosław Kwiecień.
Rektor seminarium zginął tragicznie w wypadku samochodowym pod Polanowem 13 stycznia.
Msza pogrzebowa zostanie odprawiona w kościele Mariackim w Miastku w piątek 17 stycznia o godz. 11.