Święty Malachiasz we współczesnym świecie dał się zapamiętać jako rzekomy stwórca listy papieży, w której opisał poszczególne głowy Kościoła. Lista powstała w 1139 roku i zawiera 112 imion kolejnych papieży. Zdaniem proroka, gdy władzę w Watykanie przejmie ostatni papież - "Piotr Rzymianin" nastąpi apokalipsa. Zdaniem niektórych badaczy owym ostatnim zwierzchnikiem Kościoła ma być papież Franciszek. Jest on bowiem 112 papieżem, a jego patron św. Franciszek z Asyżu miała na drugie Piotr. Również nietypowy sposób i czas wybrania go na głowę Watykanu budzi wśród części osób kontrowersje.
Według słów św. Malachiasza to za panowania ostatniego papieża Miasto Siedmiu Wzgórz, czyli Rzym ma zostać zniszczone, a ludzi czeka zagłada i sąd ostateczny. Jednak zdaniem części badaczy owa lista budzi wiele kontrowersji. Każdemu z panującym papieży przypisany jest lakoniczny i niejasny opis, który można dowolnie interpretować. Również nie ma pewności co do autentyczności spisu. Miał on powstać w 1139 roku po wizji jakiej doświadczył Malachiasz, przypuszcza się jednak, że powstała ona dużo później. Pierwsze historyczne doniesienie o liście papieży pojawiają się bowiem dopiero w 1590 roku, a część badaczy, uważa że powstała ona w celu wybrania pożądanego kandydata na papieża.