Do lutego 2019 roku Jacek Karnowski był członkiem rady nadzorczej Portu Lotniczego Gdańsk Sp. z o.o., gdzie w ciągu nieco ponad miesiąca zarobił ponad 8,8 tysiąca złotych. Od 25 czerwca 2019 roku jest natomiast członkiem rady nadzorczej Pomorskiego Funduszu Rozwoju Sp. z o.o. Z tego tytułu prezydent Sopotu tylko w 2019 roku osiągnął dochód w wysokości przeszło 25,5 tysiąca złotych.