Ołtarz powstaje od 17 lat, a jego inicjatorem był poprzedni proboszcz ks. prałat Henryk Jankowski i gdańscy bursztynnicy. Inspiracją dla tego dzieła były skarby Jasnej Góry wykonane właśnie z bursztynu. Autorem projektu jest Stanisław Radwański, rektor ASP w Gdańsku. Sam ołtarz powstaje jako wotum wdzięczności Opatrzności Bożej za dar niepodległości i św. Jana Pawła II.
W centrum ołtarza znajduje się obraz Matki Boskiej - Opiekunki Ludzi Pracy. Suknię z długim trenem wykonano z unikatowego białego bursztynu. Z kolei pod gotyckim sklepieniem prezbiterium, znajduje się biały orzeł. U dołu ołtarza dostrzec można figury św. Jana Pawła II oraz prymasa Stefana Wyszyńskiego. Ponad nimi widnieją wizerunki św. Brygidy, patronki kościoła oraz św. Marii Elżbiety Hasselblad.
>>>Zamiast Dąbrowszczaków, ulica Lecha Kaczyńskiego. Wojewoda Pomorski zmienia nazwy ulic w Gdańsku
W ołtarzu znajduje się również bursztynowa monstrancja oraz relikwiarze z relikwiami serca i krwi św. Jana Pawła II oraz bł. ks. Jerzego Popiełuszki. W planach jest również umieszczenie na ołtarzu bursztynowych łanów zbóż oraz polskich krzyży. wszystkie elementy wykonują bursztynnicy Mariusz Drapikowski, Leszek Sobiech i Iwona Pomoryn.
16 grudnia o godz. 16.00 zaplanowano uroczyste poświęcenie Bursztynowego Ołtarza Ojczyzny przez nuncjusza apostolskiego arcybiskupa Salvatore Pennacchio. Na uroczystości obecni będą m.in. prezydent RP Andrzej Duda i abp Sławoj Leszek Głódź. Dzień wcześniej organizowany jest koncert symfoniczny orkiestry Polskiej Filharmonii Bałtyckiej.