Janusz Morgenstern na kartach historii polskiej kinematografi zapisał się głównie jako reżyser.
Był autorem filmów "Jowita", "Do widzenia do jutra", a ostatnio "Mniejszego zła". Reżyserował serial „Kolumbowie” i „Polskie drogi”. To on wymyślił scenę z płonącymi kieliszkami w filmie „Popiół i diament”.
Ostatni widzieliśmy go na ekranie jako aktora w filmie „Uwikłanie”.