Krzysztof Krauze od 2004 był mężęm Joanny Kos-Krauze, z którą współtworzył swoje filmy. Byli zgranym duetem zarówno w życiu prywatnym, jak i na planie filmowym. Ich wspólnymi dziełami były 3 licznie nagradzane obrazy: "Mój Nikifor", "Plac Zbawiciela" i "Papusza".
Zanim Krzysztof Krauze związał się z Joanną Kos-Krauze był trzykrotnie żonaty. Po raz pierwszy ślub wziął już w wieku 21 lat, jednak to małżeństwo przetrwało zaledwie 9 miesięcy. Drugą wybranką jego serca była aktorka Ewa Sałacka, z którą spędził blisko 4 lata swojego życia. Przed stanem wojennym wyjechali z Polski i zamieszkali za granicą - najpierw w Wiedniu, potem w Paryżu. Po powrocie do kraju rozstali się.
Z trzeciego, trwającego 12 lat małżeństwa z Małgorzatą Szurmiej, ma córkę Sarę Karolinę, która jest jego jedynym dzieckiem.
Zobacz też: NIE ŻYJE Krzysztof Krauze - wyreżyserował Plac Zbawiciela i Papuszę. Miał 61 lat
Zobacz też: Krzysztof Krauze NIE ŻYJE. Kim był, co osiągnął?