Córka Lidii i Czesława Mackiewiczów, urodzona w 1943 roku w Machowie. Ojciec walczył w wileńskej AK, jeden z jego braci walczył pod Monte Cassino, a drugi zginął w Katyniu. Po II wojnie światowej rodzina Marii Kaczyńskiej została repatriowana z Wilna.
Lecha Kaczyńskiego poznała w 1976, dwa lata później wzięli ślub. W 1980 roku przyszła na świat ich jedyna córka Marta.