Teoria 1: Zaczadzenie
Teoria o możliwym zaczadzeniu Madzi powstała gdy wydostały się informacje, że we krwi była karbohemoglogina. Ten składnik mógł świadczyć, że śmierć nastąpiła w wyniku zatrucia czadem. Ta teoria został jednak obalona.
Ekspertyzy kominiarzy wykazały jednak, że piec w mieszkaniu Waśniewskich był sprawny i nikt przy nim nie manipulował.
Teoria 2: Zatrucie
O ewentualnym zatrucie zrobiło się głośno gdy wyszło na jaw, ze prokuratura zleciła wykonanie badań toksykologicznych krwi Madzi. Jakie są ich wyniki? Tego nie wiadomo, jednak sam fakt, że śledczy je zlecili świadczy o tym, że w stawiono hipotezę, że Madzia mogła zostać otruta.
Teoria 3: Madzia nie żyła 2 dni wcześniej?
Niezależnie od bezpośredniej przyczyny śmierci, do rozwikłania pozostaje jeszcze kwestia tego kiedy Madzia zmarła. Tu pojawiły się informacje, że dziecko mogło nie żyć już 2 dni przed tym jak rodzice zgłosili zaginięcie. Teoria wydaje się jednak mało prawdopodobna, ponieważ mają być jednak świadkowie, którzy widzieli 24 stycznia Madzię żywą.
Z drugiej strony nie ma też jednoznacznie przesądzić, że Madzia zmarła w chwili gdy uderzyła głową o próg. Wstępna sekcja zwłok wykazała uraz, ale prokuratura wciąż nie podaje dokładniej godziny śmierci dziecka.